どこにでもいるような普通の少女、苗木こまる。彼女は人類史上最大最悪の絶望的事件から1年半が経った今も、家族と離れ離れの監禁生活を強いられていた。希望を捨て、すっかり監禁生活を受け入れていたこまるだったが･･･そんな彼女を更なる絶望が襲う。彼女の長い監禁生活を終わらせたのはヒーローでも救世主でもなく･･･モノクマだった。容赦なく襲いかかるモノクマから逃げ、1年半ぶりに外の世界に出たこまるは驚愕する。そこは、モノクマを操るコドモ達がオトナ達を狩っている絶望の世界だったのだ。生き残る為の頼みの綱はある人物から渡された「拡声器型ハッキング銃」と･･･偶然であった、腐川冬子という1人の少女だった。ゲーム紹介拡声器型ハッキング銃プログラムのコードをコトダマとして発射し、対象の機器にさまざまな効果を与える拡声器ハッキング銃。攻撃の際にモノクマの赤い左目を狙って打てば、「NICE SHOT」となり、通常のモノクマなら一撃で倒せるほどの大きなダメージを与えることができる。デコダマ攻撃用のコトダマは、ショップで購入可能な「デコダマ」をセットすることで威力や装填数、連射性能が強化可能。やりこみ要素マップ上には、さまざまな読み込みや収集物が存在する。ストーリー上では語られない世界の現状を知ることができたり、特別な会話イベントが発生したりと、絶対絶望少女をより深く楽しむことができる。